常德市疾病預防控制中心的前身是常德市衛生防疫站。1963年創建，當時名為常德地區衛生防疫站，文革中一度被撤并，1972年恢復，1988年地改市后，更名為常德市衛生防疫站；1997年通過全國性等級評審被認定為國家地市級一等衛生防疫站；2003年9月更為現名。

  常德市疾病預防控制中心是政府舉辦的實施疾病預防控制與公共衛生技術管理和服務的公益型事業單位，是衛生局其下的副處級全額撥款事業單位。中心位于常德市朗州路633號，占地面積12133.16平方米，辦公場所建筑面積為5800平方米，建有檢測檢驗樓、預防醫學門診樓、體檢樓和4棟職工宿舍。現有在編在職人員93人，中心擁有生物安全柜、液相色譜儀、原子吸收分光光度計等大小儀器設備308臺（件），其主要工作職能、工作職責、工作重點是疾病預防控制和公共衛生檢測檢驗。